紐約自然博物館重新開張，博物小保安賴瑞·戴利（本·斯蒂勒 Ben Stiller 飾）帶領泰迪·羅斯福（羅賓·威廉姆斯 Robin Williams 飾）策劃瞭精彩的館奇開幕演出。誰知演出剛剛沒多久，妙夜泰迪、博物猴子他們便陷入混亂，館奇所有博物館的妙夜夥伴們大鬧會場，賴瑞為此焦頭爛額。博物事後他 發現，館奇復活黃金碑正被綠色的妙夜物質腐蝕，而這種情況似乎導致瞭藏品們的博物瘋狂。賴瑞查找資料，館奇斷定黃金碑背後隱藏著不為人知的妙夜秘密。為瞭阻止混亂情況的博物蔓延，他決定前往大英博物館求助法老王阿卡曼拉的館奇父親，當然那堆搞怪的妙夜藏品也都尾隨而至。途中他們遇見瞭圓桌騎士蘭斯洛特爵士，還和屋大維等夥伴走散。 久違的奇妙冒險，就在夜幕下的大英博物館的展開……
