炎炎夏日，哆啦大雄島為瞭找到所向披靡的與奇獨角仙，大雄（大原めぐみ 配音）痛哭流涕，哆啦大雄島對哆拉A夢（水田わさび 配音）軟磨硬泡。與奇無奈之下，哆啦大雄島哆拉A夢和哆拉美（千秋 配音）拿出時光圈，與奇幫大雄在500年前的哆啦大雄島新西蘭尋找獨角仙，誰知卻意外抓到瞭早已滅絕的與奇恐鳥。為瞭不至於讓恐鳥走向滅亡，哆啦大雄島他們決定將其送往奇跡之島。與奇奇跡之島是哆啦大雄島由未來的科學傢開發的專門用來收留、保護、與奇研究滅絕動物的哆啦大雄島小島，傳說島上有一隻黃金獨角仙，與奇它可為當地的哆啦大雄島生物註入生命的力量。一波三折，大雄和小夥伴們來到瞭這裡，並且結識瞭和大雄極其相像的神秘少年達凱（野沢雅子 配音）以及善良的洛科洛族。與此同時，一個黑心商人圖謀抓住黃金獨角仙……　　本片為哆拉A夢誕生前100年的紀念之作。